آقابابائی علاوه بر تجربه حضور در نظام بانکی کشور، دارای سوابق مدیریتی در نهادهای مالی نظیر شرکتهای سرمایهگذاری و کارگزاریها است.
وی پیش از این بعنوان مدیرعامل شرکت سرمایهگذاری سپه به خدمت مشغول بود و قبل از آن مدیریت عامل صندوق تثبیت بازار سرمایه را بر عهده داشت.
وی همچنین دارای مدرک دکترای علوم اقتصادی از دانشگاه تهران و عضو هیأت علمی دانشگاه خوارزمی است
گفتنی است، در مراسمی با حضور دکتر مرادپور سرپرست معاونت بانک و بیمه وزارت امور اقتصادی و دارایی و همچنین هیئت مدیره و مدیران صندوق بازنشستگی کارکنان بانکها، سیدمهدی سدیدی تودیع و محمد ابراهیم آقابابائی معارفه شد.